Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCSAMQ8N6F7 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms