Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Y2

CRACR2B, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2BQ8N4Y2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRACR2BQ8N4Y2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRACR2BQ8N4Y2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRACR2BQ8N4Y2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRACR2BQ8N4Y2 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRACR2BQ8N4Y2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRACR2BQ8N4Y2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRACR2BQ8N4Y2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRACR2BQ8N4Y2 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRACR2BQ8N4Y2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CRACR2BQ8N4Y2 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRACR2BQ8N4Y2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRACR2BQ8N4Y2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRACR2BQ8N4Y2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRACR2BQ8N4Y2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRACR2BQ8N4Y2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRACR2BQ8N4Y2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRACR2BQ8N4Y2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CRACR2BQ8N4Y2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRACR2BQ8N4Y2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRACR2BQ8N4Y2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRACR2BQ8N4Y2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CRACR2BQ8N4Y2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRACR2BQ8N4Y2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CRACR2BQ8N4Y2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRACR2BQ8N4Y2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRACR2BQ8N4Y2 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRACR2BQ8N4Y2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRACR2BQ8N4Y2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRACR2BQ8N4Y2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CRACR2BQ8N4Y2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CRACR2BQ8N4Y2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRACR2BQ8N4Y2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms