Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NME9Q86XW9 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms