Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKAP1Q86WV1 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKAP1Q86WV1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms