Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATG4DQ86TL0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms