Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z478

DHX29, ATP-dependent RNA helicase DHX29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX29Q7Z478 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DHX29Q7Z478 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DHX29Q7Z478 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DHX29Q7Z478 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DHX29Q7Z478 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DHX29Q7Z478 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
DHX29Q7Z478 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DHX29Q7Z478 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
DHX29Q7Z478 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DHX29Q7Z478 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DHX29Q7Z478 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DHX29Q7Z478 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DHX29Q7Z478 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms