Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z443

PKD1L3, Polycystic kidney disease protein 1-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1L3Q7Z443 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PKD1L3Q7Z443 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms