Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT27Q7Z3Y8 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT27Q7Z3Y8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms