Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms