Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
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USP43Q70EL4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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USP43Q70EL4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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USP43Q70EL4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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USP43Q70EL4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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