Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNY1

BLOC1S2, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLOC1S2Q6QNY1 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BLOC1S2Q6QNY1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BLOC1S2Q6QNY1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms