Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q795

Putative viral protein-binding protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6Q795 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6Q795 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6Q795 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6Q795 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6Q795 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6Q795 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6Q795 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6Q795 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6Q795 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6Q795 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6Q795 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6Q795 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6Q795 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6Q795 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6Q795 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6Q795 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6Q795 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6Q795 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6Q795 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6Q795 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6Q795 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6Q795 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6Q795 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6Q795 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6Q795 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6Q795 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6Q795 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6Q795 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6Q795 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6Q795 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6Q795 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6Q795 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6Q795 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6Q795 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6Q795 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q6Q795 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6Q795 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6Q795 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6Q795 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6Q795 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6Q795 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6Q795 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6Q795 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6Q795 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6Q795 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6Q795 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6Q795 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6Q795 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6Q795 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6Q795 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6Q795 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6Q795 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6Q795 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6Q795 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6Q795 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6Q795 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6Q795 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6Q795 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6Q795 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6Q795 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6Q795 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6Q795 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6Q795 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6Q795 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6Q795 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6Q795 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6Q795 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6Q795 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6Q795 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q6Q795 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6Q795 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6Q795 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6Q795 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6Q795 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6Q795 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6Q795 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6Q795 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6Q795 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6Q795 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6Q795 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6Q795 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6Q795 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6Q795 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6Q795 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6Q795 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6Q795 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6Q795 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6Q795 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6Q795 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6Q795 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6Q795 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6Q795 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6Q795 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6Q795 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6Q795 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6Q795 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6Q795 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6Q795 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6Q795 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q6Q795 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms