Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTR9Q6PD62 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTR9Q6PD62 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms