Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE6

LCN10, Epididymal-specific lipocalin-10, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN10Q6JVE6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LCN10Q6JVE6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LCN10Q6JVE6 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms