Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ANKRD40Q6AI12 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
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