Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CHIC1Q5VXU3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CHIC1Q5VXU3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CHIC1Q5VXU3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CHIC1Q5VXU3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
CHIC1Q5VXU3 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CHIC1Q5VXU3 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CHIC1Q5VXU3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CHIC1Q5VXU3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CHIC1Q5VXU3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CHIC1Q5VXU3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CHIC1Q5VXU3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
CHIC1Q5VXU3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CHIC1Q5VXU3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CHIC1Q5VXU3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CHIC1Q5VXU3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CHIC1Q5VXU3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CHIC1Q5VXU3 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CHIC1Q5VXU3 IFNA16-201ENST00000380216 939 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CHIC1Q5VXU3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CHIC1Q5VXU3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CHIC1Q5VXU3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
CHIC1Q5VXU3 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CHIC1Q5VXU3 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CHIC1Q5VXU3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CHIC1Q5VXU3 AC109466.1-203ENST00000524297 1083 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CHIC1Q5VXU3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CHIC1Q5VXU3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CHIC1Q5VXU3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CHIC1Q5VXU3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 AC115102.1-201ENST00000558044 487 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CHIC1Q5VXU3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms