Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU97

CACHD1, VWFA and cache domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACHD1Q5VU97 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACHD1Q5VU97 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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