Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGS0

NEXMIF, Neurite extension and migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEXMIFQ5QGS0 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEXMIFQ5QGS0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEXMIFQ5QGS0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEXMIFQ5QGS0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEXMIFQ5QGS0 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEXMIFQ5QGS0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEXMIFQ5QGS0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEXMIFQ5QGS0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NEXMIFQ5QGS0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEXMIFQ5QGS0 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEXMIFQ5QGS0 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEXMIFQ5QGS0 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEXMIFQ5QGS0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEXMIFQ5QGS0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEXMIFQ5QGS0 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEXMIFQ5QGS0 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEXMIFQ5QGS0 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEXMIFQ5QGS0 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEXMIFQ5QGS0 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NEXMIFQ5QGS0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEXMIFQ5QGS0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEXMIFQ5QGS0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEXMIFQ5QGS0 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEXMIFQ5QGS0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEXMIFQ5QGS0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEXMIFQ5QGS0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NEXMIFQ5QGS0 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEXMIFQ5QGS0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NEXMIFQ5QGS0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEXMIFQ5QGS0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms