Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJD5

TMEM41B, Transmembrane protein 41B, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM41BQ5BJD5 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM41BQ5BJD5 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms