Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SFT2D3Q587I9 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFT2D3Q587I9 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms