Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKDCCQ504Y2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKDCCQ504Y2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PKDCCQ504Y2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PKDCCQ504Y2 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PKDCCQ504Y2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PKDCCQ504Y2 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PKDCCQ504Y2 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PKDCCQ504Y2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKDCCQ504Y2 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms