Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms