Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM259Q4ZIN3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms