Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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CTF1Q16619 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CTF1Q16619 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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