Protein–RNA interactions for Protein: Q16612

NREP, Neuronal regeneration-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NREPQ16612 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NREPQ16612 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NREPQ16612 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
NREPQ16612 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NREPQ16612 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NREPQ16612 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NREPQ16612 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NREPQ16612 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
NREPQ16612 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NREPQ16612 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
NREPQ16612 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
NREPQ16612 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NREPQ16612 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
NREPQ16612 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
NREPQ16612 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
NREPQ16612 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
NREPQ16612 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
NREPQ16612 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NREPQ16612 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NREPQ16612 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
NREPQ16612 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NREPQ16612 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
NREPQ16612 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
NREPQ16612 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NREPQ16612 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NREPQ16612 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NREPQ16612 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
NREPQ16612 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
NREPQ16612 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
NREPQ16612 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NREPQ16612 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NREPQ16612 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NREPQ16612 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NREPQ16612 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
NREPQ16612 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
NREPQ16612 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NREPQ16612 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
NREPQ16612 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NREPQ16612 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NREPQ16612 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
NREPQ16612 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
NREPQ16612 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NREPQ16612 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
NREPQ16612 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NREPQ16612 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
NREPQ16612 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NREPQ16612 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
NREPQ16612 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
NREPQ16612 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NREPQ16612 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
NREPQ16612 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
NREPQ16612 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
NREPQ16612 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NREPQ16612 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NREPQ16612 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
NREPQ16612 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NREPQ16612 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NREPQ16612 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NREPQ16612 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
NREPQ16612 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NREPQ16612 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NREPQ16612 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
NREPQ16612 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NREPQ16612 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NREPQ16612 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
NREPQ16612 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
NREPQ16612 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NREPQ16612 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NREPQ16612 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.44□□□□□ -0.58
NREPQ16612 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NREPQ16612 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
NREPQ16612 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NREPQ16612 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
NREPQ16612 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NREPQ16612 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NREPQ16612 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
NREPQ16612 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
NREPQ16612 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NREPQ16612 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
NREPQ16612 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NREPQ16612 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NREPQ16612 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NREPQ16612 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
NREPQ16612 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
NREPQ16612 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
NREPQ16612 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
NREPQ16612 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
NREPQ16612 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NREPQ16612 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
NREPQ16612 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
NREPQ16612 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
NREPQ16612 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NREPQ16612 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NREPQ16612 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NREPQ16612 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NREPQ16612 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NREPQ16612 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NREPQ16612 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NREPQ16612 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
NREPQ16612 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms