Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
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SGCAQ16586 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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SGCAQ16586 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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SGCAQ16586 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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SGCAQ16586 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SGCAQ16586 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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