Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPTX1Q15818 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NPTX1Q15818 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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