Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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EFNB3Q15768 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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EFNB3Q15768 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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EFNB3Q15768 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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EFNB3Q15768 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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EFNB3Q15768 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EFNB3Q15768 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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