Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PUM3Q15397 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PUM3Q15397 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
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