Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKX1-1Q15270 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
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