Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms