Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMC1AQ14683 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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