Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEMA3AQ14563 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3AQ14563 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms