Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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