Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2H2Q13888 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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