Protein–RNA interactions for Protein: Q13885

TUBB2A, Tubulin beta-2A chain, humanhuman

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Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2AQ13885 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBB2AQ13885 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBB2AQ13885 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBB2AQ13885 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBB2AQ13885 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBB2AQ13885 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBB2AQ13885 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBB2AQ13885 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBB2AQ13885 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBB2AQ13885 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TUBB2AQ13885 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TUBB2AQ13885 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
TUBB2AQ13885 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBB2AQ13885 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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