Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA7Q13683 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA7Q13683 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA7Q13683 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA7Q13683 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA7Q13683 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA7Q13683 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA7Q13683 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA7Q13683 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA7Q13683 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA7Q13683 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA7Q13683 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA7Q13683 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA7Q13683 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ITGA7Q13683 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA7Q13683 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA7Q13683 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA7Q13683 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA7Q13683 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA7Q13683 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA7Q13683 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA7Q13683 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA7Q13683 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA7Q13683 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA7Q13683 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA7Q13683 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA7Q13683 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA7Q13683 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA7Q13683 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA7Q13683 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA7Q13683 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA7Q13683 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA7Q13683 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ITGA7Q13683 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA7Q13683 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA7Q13683 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA7Q13683 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA7Q13683 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA7Q13683 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA7Q13683 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA7Q13683 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA7Q13683 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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ITGA7Q13683 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA7Q13683 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
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ITGA7Q13683 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA7Q13683 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ITGA7Q13683 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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ITGA7Q13683 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGA7Q13683 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGA7Q13683 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGA7Q13683 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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ITGA7Q13683 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGA7Q13683 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGA7Q13683 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGA7Q13683 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGA7Q13683 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGA7Q13683 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGA7Q13683 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGA7Q13683 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGA7Q13683 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGA7Q13683 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGA7Q13683 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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ITGA7Q13683 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ITGA7Q13683 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ITGA7Q13683 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
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