Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTCH1Q13635 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
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