Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CUL4BQ13620 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL4BQ13620 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
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