Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MTMR3Q13615 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
MTMR3Q13615 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MTMR3Q13615 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MTMR3Q13615 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MTMR3Q13615 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MTMR3Q13615 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MTMR3Q13615 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MTMR3Q13615 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
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