Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BFSP2Q13515 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms