Protein–RNA interactions for Protein: Q13506

NAB1, NGFI-A-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAB1Q13506 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NAB1Q13506 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms