Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
ITGB3BPQ13352 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGB3BPQ13352 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms