Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLF1Q13351 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLF1Q13351 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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