Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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SKP2Q13309 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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SKP2Q13309 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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SKP2Q13309 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SKP2Q13309 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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