Protein–RNA interactions for Protein: Q13285

NR5A1, Steroidogenic factor 1, humanhuman

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Length 461 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR5A1Q13285 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NR5A1Q13285 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms