Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SEMA3BQ13214 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
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