Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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IFT88Q13099 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
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IFT88Q13099 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFT88Q13099 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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