Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GPS1Q13098 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPS1Q13098 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.5 ms