Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PTPN13Q12923 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
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PTPN13Q12923 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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PTPN13Q12923 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN13Q12923 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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